More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1252 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  40.97 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  37.34 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  38.31 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  40.13 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  38.49 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  35.71 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  35.39 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  37.26 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  38.18 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.18 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  34.3 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  36.3 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  38.71 
 
 		 315 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  34.53 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  37.82 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  35.18 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.18 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  35.82 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  35.31 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  39.52 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.98 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.98 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  34.98 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  37.17 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  37.74 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  38.44 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  35.96 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  37.74 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  36.94 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  36.09 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  37.55 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  38.71 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.77 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  35.62 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  31.72 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  35.28 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 324 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  31.72 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.88 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  36.16 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.6 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  32.46 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  35.43 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  38.14 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  34.2 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.25 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  31.72 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  36.54 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  35.56 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  32.9 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  32.14 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  31.92 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  39.48 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 314 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.36 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  33.98 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  38.78 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  39.04 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  36.5 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  38.56 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  36.21 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  33.77 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.26 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  35.71 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  34.98 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  38.75 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>