More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1250 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  100 
 
 		 146 aa  299  9e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 144 aa  213  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  69.5 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  71.43 
 
 		 148 aa  207  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  64.06 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  63.28 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  55.7 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  61.07 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  58.09 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  63.97 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  58.09 
 
 		 147 aa  173  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  172  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  56.76 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  61.72 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  59.54 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 163 aa  170  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  56.08 
 
 		 149 aa  170  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 149 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 149 aa  169  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  58.39 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  57.53 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 170 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 150 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  57.53 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 150 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  63.43 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  55 
 
 		 154 aa  166  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  59.84 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  56.49 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  59.84 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>