284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1232 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
453 aa  914  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.15653e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  41.37 
 
 
348 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 
352 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.52958e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
294 aa  197  4e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 
284 aa  185  1e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  34.04 
 
 
291 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.58752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 
283 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.79545e-07  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  37.55 
 
 
461 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  36.44 
 
 
292 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  9.2664e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 
281 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  37.15 
 
 
461 aa  175  1e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.74812e-07 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  37.15 
 
 
461 aa  174  4e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.47347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  35.82 
 
 
390 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  34.42 
 
 
443 aa  172  8e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  36.76 
 
 
461 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  36.76 
 
 
461 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  34.94 
 
 
286 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 
406 aa  167  3e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
320 aa  166  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.16269e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
318 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.61549e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 
421 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  34.73 
 
 
451 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  36.44 
 
 
300 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  35.89 
 
 
300 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  36.03 
 
 
300 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  36.03 
 
 
300 aa  156  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  36.03 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  36.03 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  35.22 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 
295 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.21991e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  36.03 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  35.22 
 
 
300 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 
300 aa  154  3e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 
300 aa  154  3e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  36.67 
 
 
257 aa  146  7e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
451 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
300 aa  140  4e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.66822e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 
363 aa  140  5e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.23 
 
 
682 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 
367 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 
479 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.91 
 
 
679 aa  138  3e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  31.35 
 
 
291 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  33.6 
 
 
336 aa  137  6e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  32.27 
 
 
454 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
374 aa  132  2e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  32.65 
 
 
502 aa  131  2e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
423 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.52 
 
 
808 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
386 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.19 
 
 
771 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.6 
 
 
780 aa  121  2e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.68 
 
 
761 aa  120  4e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.63 
 
 
814 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.2 
 
 
789 aa  117  4e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.75 
 
 
752 aa  114  4e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.25 
 
 
795 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.74 
 
 
734 aa  113  7e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  8.11582e-08 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.16 
 
 
775 aa  113  8e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.2809e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  28.79 
 
 
795 aa  112  1e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.26 
 
 
818 aa  111  2e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.74 
 
 
796 aa  111  2e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.93 
 
 
883 aa  112  2e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 
477 aa  109  8e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.87 
 
 
750 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.77 
 
 
773 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.73 
 
 
798 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.77 
 
 
840 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  29.7 
 
 
888 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.02 
 
 
791 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.17 
 
 
331 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.37 
 
 
778 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.66 
 
 
773 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  4.34572e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.73 
 
 
773 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.63 
 
 
809 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.95 
 
 
757 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.97686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.73 
 
 
654 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.20337e-08 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  29.73 
 
 
773 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.8 
 
 
797 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.97 
 
 
773 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.46 
 
 
772 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.46 
 
 
772 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.39 
 
 
773 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  29.27 
 
 
761 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.21236e-05  hitchhiker  6.73843e-07 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.39 
 
 
773 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.17 
 
 
770 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.84 
 
 
749 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.83 
 
 
759 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.23 
 
 
794 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.9 
 
 
758 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.882312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1600  hydrolase of metallo-beta-lactamase fold  29.1 
 
 
281 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.949503  unclonable  2.1744e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.68 
 
 
745 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  26.81 
 
 
872 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
783 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  32.05 
 
 
808 aa  97.8  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.54 
 
 
812 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
772 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 
868 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003988  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.98 
 
 
752 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.24 
 
 
786 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>