More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1218 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1218  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  100 
 
 
517 aa  1076    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000328794  normal  0.498702 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00220  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  50 
 
 
493 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0381086  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2014  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  33.33 
 
 
483 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0387  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L- lysine ligase  33.91 
 
 
481 aa  217  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00219663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1733  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.99 
 
 
523 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000851319  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1391  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L- lysine ligase  30.61 
 
 
484 aa  202  9e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0480211  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0221  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  34.39 
 
 
517 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0479  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.39 
 
 
486 aa  200  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000570069  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0735  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.42 
 
 
490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0773  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  30.13 
 
 
486 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.03528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1987  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.18 
 
 
483 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000686908  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0897  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.75 
 
 
499 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0978  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.49 
 
 
485 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00408283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4016  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  33.05 
 
 
495 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00414729  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1273  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  30.84 
 
 
498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.955729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1226  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.91 
 
 
491 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0216254  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4015  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  31.11 
 
 
491 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.51232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1937  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  31.87 
 
 
516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0653  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  29.09 
 
 
501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  29.81 
 
 
493 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3673  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.83 
 
 
491 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.307291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1657  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  33.2 
 
 
532 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3929  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.63 
 
 
491 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3656  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.63 
 
 
491 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3765  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.63 
 
 
491 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4053  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.63 
 
 
491 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  29.76 
 
 
493 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000060186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate ligase  30.54 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00917658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3960  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.22 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3967  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.22 
 
 
491 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09040  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  29.32 
 
 
499 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1441  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.61 
 
 
499 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2305  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  31.29 
 
 
512 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3741  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.3 
 
 
491 aa  171  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1830  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  27.96 
 
 
484 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1016  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.29 
 
 
490 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2116  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  27.53 
 
 
484 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2495  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.72 
 
 
493 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3774  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.43 
 
 
491 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00975768  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0867  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  30.27 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2564  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.51 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0043883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2629  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.33 
 
 
499 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0951  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.16 
 
 
508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0293  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.99 
 
 
489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0445  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  29.37 
 
 
497 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0384  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.3 
 
 
481 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3267  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.71 
 
 
523 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.997765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2414  Mur ligase family protein  33.42 
 
 
401 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00339863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2931  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  30.71 
 
 
515 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00367837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1816  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.41 
 
 
487 aa  159  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1806  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  29.41 
 
 
487 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0843  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.47 
 
 
518 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1888  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.96 
 
 
489 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3979  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  31.97 
 
 
506 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12188  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.78 
 
 
535 aa  156  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000211725  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2979  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  30.74 
 
 
491 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2457  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.23 
 
 
494 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0277  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  29.63 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2503  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.35 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1050  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  29.07 
 
 
498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10760  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.94 
 
 
525 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0050  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  30.8 
 
 
516 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.046851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3929  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.15 
 
 
533 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00450416  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0277  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.26 
 
 
501 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1569  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.28 
 
 
492 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3443  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.24 
 
 
515 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427791  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0794  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.46 
 
 
509 aa  150  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346538  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0670  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.02 
 
 
486 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3520  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  29.75 
 
 
491 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130908  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0821  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetases  28.02 
 
 
489 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.250872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3330  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  28.94 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2802  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  27.46 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69685  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01510  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.37 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.652641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4470  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  29.41 
 
 
530 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2983  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  31.84 
 
 
512 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415653  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2705  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.6 
 
 
511 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1005  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.94 
 
 
522 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  0.0358362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1105  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  31.92 
 
 
534 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.664687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4739  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.78 
 
 
498 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155183  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1782  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.28 
 
 
548 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1511  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.18 
 
 
479 aa  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1147  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.34 
 
 
496 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0858066  normal  0.029203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2115  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  30.75 
 
 
523 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1252  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  29.65 
 
 
492 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.799294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3217  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.57 
 
 
514 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0515393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0099  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetases  33.26 
 
 
488 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0663  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  27.37 
 
 
491 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4221  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.32 
 
 
496 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4151  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  28.54 
 
 
509 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1600  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.72 
 
 
486 aa  143  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.285187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0486  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.06 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2898  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase/UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase  29.84 
 
 
1005 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0758  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.1 
 
 
495 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0503  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.14 
 
 
505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0202  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase (UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase)  28.45 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0619  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.33 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.850336  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0467  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  36.14 
 
 
599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0681  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  29.09 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3528  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  30.41 
 
 
497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.176869  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4068  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.48 
 
 
495 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>