More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1161 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  100 
 
 		 206 aa  425  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  62.14 
 
 		 206 aa  270  8.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  64.08 
 
 		 206 aa  265  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16240  LSU ribosomal protein L3P  59.71 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0560879  hitchhiker  0.00000737829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  56.65 
 
 		 209 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  59.42 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 		 209 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  57.28 
 
 		 222 aa  231  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 209 aa  231  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 211 aa  230  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  55.94 
 
 		 209 aa  228  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  55.72 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  58.71 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  51.74 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  54.68 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  58.21 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 216 aa  217  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  58.21 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  55.67 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  56.8 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  55.17 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  49.5 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  54.19 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  52.43 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  55.67 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  50.97 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  54.23 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  53.73 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  48.74 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  207  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  46.5 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 211 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 211 aa  205  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 212 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 212 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 216 aa  204  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 		 211 aa  204  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>