More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1159 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 99 aa  202  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  61.7 
 
 		 95 aa  123  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  62.77 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  60.64 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  57.45 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  57.29 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  51.09 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  55.79 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  52.81 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 94 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  51.58 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  47.92 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 94 aa  87.4  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  57.65 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  57.65 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  48.91 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  53.41 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  41.67 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  47.31 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  52.27 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  48.98 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  50.59 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  46.07 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  44.9 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  43.01 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  43.01 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  43.48 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  46.24 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  45.98 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  48.19 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  42.71 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>