More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1150 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  100 
 
 		 105 aa  203  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  61.9 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  60.2 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  60.4 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  60.61 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  60.61 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  58.16 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  59 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  59.18 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  58.16 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  55.1 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  60 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  56.12 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  55.1 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  52.48 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  52.04 
 
 		 109 aa  100  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  51.02 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  51.4 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  59.6 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  50 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  47.66 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  42.97 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0730  ribosomal protein L24  55.1 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00351151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>