More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1147 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  100 
 
 
132 aa  266  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.86706e-07  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  72.73 
 
 
132 aa  203  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.76447e-06  hitchhiker  1.37084e-07 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  73.48 
 
 
132 aa  200  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  69.7 
 
 
132 aa  196  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  1.36856e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  59.09 
 
 
132 aa  171  2e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  59.09 
 
 
132 aa  168  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
132 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  167  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
133 aa  164  3e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  162  1e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  162  1e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  162  1e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  160  5e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  160  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  159  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  2.84397e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  1.38076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  56.06 
 
 
132 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  4.55347e-08  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  55.88 
 
 
136 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  56.82 
 
 
132 aa  157  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  157  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  3.16434e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  3.69377e-05  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 
135 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  56.2 
 
 
135 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
132 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  53.79 
 
 
132 aa  154  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  1.58451e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  55.3 
 
 
132 aa  154  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
130 aa  153  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  4.78289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  54.41 
 
 
136 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 
132 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 
135 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 
134 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  53.33 
 
 
135 aa  151  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  151  3e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  51.54 
 
 
131 aa  150  6e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  56.72 
 
 
136 aa  150  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  54.07 
 
 
135 aa  149  9e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
131 aa  149  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.33012e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  2.18378e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.45465e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
130 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.72145e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  1.88552e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.8536e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  4.52809e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  7.64714e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  53.79 
 
 
132 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  54.96 
 
 
131 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3737  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
130 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.62987e-06  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  53.79 
 
 
132 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  55.38 
 
 
131 aa  147  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0419  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
130 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000465732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
132 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  52.31 
 
 
134 aa  146  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 
132 aa  146  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.37802e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
130 aa  146  1e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0597  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
130 aa  146  1e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.01428e-08  normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
130 aa  146  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.34775e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
130 aa  146  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  7.47182e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  146  1e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.28717e-28 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3987  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
130 aa  146  1e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0073999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 
130 aa  146  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.09251e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  145  2e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.54317e-09  unclonable  1.46513e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.16269e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.39316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
131 aa  145  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.96885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  57.35 
 
 
136 aa  145  2e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4303  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
130 aa  145  2e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.2409e-08  unclonable  5.62401e-11 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  4.92709e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  2e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.99604e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 
133 aa  144  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0334  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
130 aa  144  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4530  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 
130 aa  144  4e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.4022e-07  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  144  4e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.79838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  144  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  55.38 
 
 
134 aa  144  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  49.24 
 
 
132 aa  143  7e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0074  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
130 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  5.74269e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
132 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.10605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  49.24 
 
 
132 aa  142  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001728  SSU ribosomal protein S8p (S15Ae)  53.79 
 
 
130 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.20739e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>