More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1145 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  100 
 
 
122 aa  246  9e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  5.49459e-07  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  63.93 
 
 
122 aa  164  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  1.28953e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  157  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  61.48 
 
 
122 aa  156  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  9.83895e-07 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
119 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
119 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  63.96 
 
 
121 aa  140  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  59.48 
 
 
120 aa  139  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  61.48 
 
 
120 aa  139  1e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 
120 aa  137  4e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  65.57 
 
 
122 aa  136  8e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.99642e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  65.57 
 
 
122 aa  136  8e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  63.72 
 
 
120 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  57.38 
 
 
118 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  61.06 
 
 
122 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 
122 aa  134  3e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  61.95 
 
 
120 aa  134  3e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
120 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  64.86 
 
 
118 aa  134  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  58.72 
 
 
124 aa  133  7e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
120 aa  132  1e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 
122 aa  132  2e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  54.92 
 
 
122 aa  130  7e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 
120 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 
120 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
118 aa  128  2e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 
122 aa  129  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  60.4 
 
 
120 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 
122 aa  127  4e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
118 aa  127  4e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  50.82 
 
 
122 aa  127  5e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  61.76 
 
 
122 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  61.76 
 
 
122 aa  127  7e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  57.66 
 
 
118 aa  126  8e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 
122 aa  126  9e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 
122 aa  126  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
122 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 
120 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  4.32903e-05  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  55.45 
 
 
122 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
120 aa  124  4e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  57.66 
 
 
125 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 
121 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
119 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  52.17 
 
 
118 aa  123  8e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.579e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 
120 aa  123  8e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  56.88 
 
 
122 aa  122  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
114 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 
120 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
120 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  59.46 
 
 
119 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  55 
 
 
121 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 
120 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  58.42 
 
 
121 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
120 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  54.47 
 
 
121 aa  120  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  120  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
120 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
120 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
117 aa  120  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  50.82 
 
 
121 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  51.33 
 
 
120 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  7.4744e-08 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 
119 aa  120  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 
120 aa  119  1e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  119  1e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  53.78 
 
 
122 aa  119  2e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 
120 aa  118  2e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
120 aa  119  2e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.57 
 
 
124 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  52.73 
 
 
116 aa  117  4e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
114 aa  117  4e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  55.26 
 
 
121 aa  117  4e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
120 aa  117  5e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
120 aa  117  5e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
116 aa  117  7e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
119 aa  116  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
120 aa  116  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
119 aa  116  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
115 aa  116  1e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  53.04 
 
 
118 aa  116  1e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  55.36 
 
 
120 aa  116  1e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 
120 aa  116  1e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 
120 aa  115  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  55.45 
 
 
127 aa  115  2e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  54.9 
 
 
120 aa  115  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  51.72 
 
 
119 aa  115  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 
120 aa  115  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
120 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 
121 aa  114  4e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>