More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1142 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  100 
 
 
148 aa  295  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  4.49259e-07  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  69.86 
 
 
149 aa  196  8e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  2.67286e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  71.23 
 
 
149 aa  174  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23280  LSU ribosomal protein L15P  73.29 
 
 
149 aa  160  5e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.332048  hitchhiker  5.74627e-06 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  56.16 
 
 
147 aa  145  2e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  54.11 
 
 
149 aa  145  2e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 
146 aa  145  2e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 
146 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
147 aa  144  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
153 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 
153 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  51.37 
 
 
153 aa  141  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 
148 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.11424e-05  hitchhiker  3.39891e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 
146 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 
146 aa  140  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 
146 aa  140  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 
146 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
146 aa  139  1e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  7.67925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.73867e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08575e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  139  1e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 
146 aa  139  2e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  57.82 
 
 
146 aa  138  2e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.27341e-09  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
147 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 
147 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  56.55 
 
 
152 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  54.48 
 
 
158 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 
170 aa  134  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 
147 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.74697e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  54.42 
 
 
146 aa  133  7e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 
150 aa  133  7e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  2.05453e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  51.7 
 
 
152 aa  133  7e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  2.66342e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  132  1e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  53.79 
 
 
146 aa  132  1e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  4.33235e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  132  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.32499e-08 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
144 aa  132  2e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  8.60578e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 
146 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52 
 
 
153 aa  131  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  53.06 
 
 
147 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  54.48 
 
 
243 aa  131  4e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  52.74 
 
 
150 aa  130  7e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  51.02 
 
 
148 aa  129  1e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  53.38 
 
 
149 aa  129  1e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
147 aa  129  1e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  52.41 
 
 
152 aa  129  1e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
147 aa  129  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
146 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
147 aa  127  4e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
145 aa  127  4e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
161 aa  127  5e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
159 aa  126  8e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 
147 aa  126  9e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
159 aa  126  9e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 
146 aa  125  1e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.57379e-05  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  52.74 
 
 
177 aa  126  1e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
150 aa  126  1e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  1.29799e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
147 aa  125  2e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  47.62 
 
 
148 aa  125  2e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
147 aa  125  2e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.96543e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  51.03 
 
 
210 aa  124  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  51.7 
 
 
146 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  53.42 
 
 
146 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
145 aa  125  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
144 aa  124  4e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 
154 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 
148 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  3.74852e-05  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 
150 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
152 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  51.37 
 
 
153 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 
147 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.40275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  51.03 
 
 
164 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  51.35 
 
 
151 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 
148 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 
152 aa  120  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
145 aa  120  7e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
174 aa  119  1e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  46.94 
 
 
148 aa  119  1e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  118  2e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
146 aa  119  2e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  47.26 
 
 
148 aa  118  2e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  118  2e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  51.05 
 
 
162 aa  119  2e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  49.32 
 
 
144 aa  119  2e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 
149 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 
149 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  1.23814e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 
149 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 
144 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 
147 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  4.3437e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
143 aa  117  5e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.2076e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
143 aa  117  5e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
144 aa  117  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  47.59 
 
 
154 aa  117  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  50 
 
 
144 aa  117  8e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.10638e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
146 aa  116  8e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>