More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1139 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
262 aa  534  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  8.63177e-07  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  59.6 
 
 
256 aa  323  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  59.04 
 
 
259 aa  313  2e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  2.54038e-08 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
266 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
248 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  48.99 
 
 
261 aa  255  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  47.37 
 
 
251 aa  253  2e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.65586e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 
274 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
248 aa  251  9e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  47.77 
 
 
249 aa  250  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  48.4 
 
 
274 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 
249 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  50.63 
 
 
262 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 
248 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 
249 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  47.64 
 
 
256 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.42158e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  47.49 
 
 
259 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  46.56 
 
 
248 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.84186e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  46.74 
 
 
273 aa  244  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  47.83 
 
 
259 aa  244  1e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  45.97 
 
 
255 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  45.49 
 
 
264 aa  242  4e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  48.32 
 
 
248 aa  241  8e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
249 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
248 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.8209e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
248 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
248 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.06303e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
248 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.83298e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
248 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.71118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  46.15 
 
 
248 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.27766e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
248 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.01117e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  47.37 
 
 
248 aa  239  3e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.3195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
249 aa  239  3e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  46.96 
 
 
268 aa  239  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  47.79 
 
 
269 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  48.74 
 
 
265 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  46.34 
 
 
253 aa  238  6e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  46.34 
 
 
253 aa  238  6e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  45.93 
 
 
253 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
248 aa  238  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.9178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  46.09 
 
 
257 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  48.06 
 
 
258 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
249 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  44.98 
 
 
250 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  3.64172e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  44.98 
 
 
250 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.59906e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  46.48 
 
 
258 aa  235  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  47.37 
 
 
249 aa  235  5e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  44.76 
 
 
249 aa  235  5e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  46.4 
 
 
256 aa  234  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  46.15 
 
 
272 aa  234  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  42.57 
 
 
250 aa  234  1e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0675  methionine aminopeptidase, type I  45.42 
 
 
251 aa  234  1e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
264 aa  233  2e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  44 
 
 
259 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  46.75 
 
 
250 aa  232  4e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  9.54293e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  45.8 
 
 
270 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  45.82 
 
 
281 aa  231  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  45.2 
 
 
259 aa  231  7e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  45.31 
 
 
263 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.64396e-05  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1489  methionine aminopeptidase  44.53 
 
 
252 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  43.32 
 
 
247 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.64848e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
265 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  8.57488e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  43.8 
 
 
256 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  46.77 
 
 
250 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  4.62112e-06  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  46.69 
 
 
258 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  43.72 
 
 
250 aa  229  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  44.62 
 
 
257 aa  229  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  43.37 
 
 
279 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 
248 aa  228  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  46.34 
 
 
251 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  3.38054e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  45.63 
 
 
263 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  44.09 
 
 
257 aa  228  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  45.11 
 
 
236 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  45.11 
 
 
236 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.01637e-07  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1447  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
248 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  45.11 
 
 
236 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.61795e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1446  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
248 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3721  methionine aminopeptidase  44.53 
 
 
248 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1660  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
248 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.528417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  47.18 
 
 
248 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
251 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.8934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  44.31 
 
 
261 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  44.71 
 
 
256 aa  226  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  45.78 
 
 
249 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.66875e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  45.49 
 
 
258 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
255 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  45.67 
 
 
255 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.41129e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  42.97 
 
 
279 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  42.34 
 
 
248 aa  225  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  45.53 
 
 
251 aa  225  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  2.26178e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  44.31 
 
 
261 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  51.35 
 
 
264 aa  224  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  42.8 
 
 
252 aa  224  1e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  3.74486e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  42.98 
 
 
258 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  48.31 
 
 
236 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  43.32 
 
 
248 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  43.5 
 
 
249 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1590  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  45.16 
 
 
254 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>