78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1125 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 329 aa  679    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  57.01 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  53.35 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  47.23 
 
 		 341 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  28.09 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.31 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  26.96 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  25.65 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  25.22 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.76 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.22 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  22.68 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  27.98 
 
 		 674 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 671 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 970 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.81 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  26.92 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  20.5 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  19.92 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  20.21 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  22.26 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  26.47 
 
 		 658 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.51 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  22.71 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  24.41 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.22 
 
 		 722 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.49 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  20.36 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  26.51 
 
 		 659 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  23.57 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  25.66 
 
 		 659 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  19.57 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  23.83 
 
 		 656 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  25.17 
 
 		 641 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  25.17 
 
 		 641 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 		 615 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  25.17 
 
 		 641 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 1032 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>