115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1090 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1090  PSP1 domain protein  100 
 
 		 517 aa  1062    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.220883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16170  uncharacterized PSP1-like protein  53.18 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000203324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1147  PSP1 domain protein  51.96 
 
 		 526 aa  307  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.233245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09190  uncharacterized PSP1-like protein  51.69 
 
 		 443 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.221137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0160  PSP1 domain protein  48.64 
 
 		 291 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.100809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2104  PSP1  46.27 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0536  hypothetical protein  43.82 
 
 		 277 aa  229  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_477  PSP1-like protein  43.45 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0512  PSP1 domain-containing protein  43.45 
 
 		 277 aa  227  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1693  PSP-like protein  39.45 
 
 		 366 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000254469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1909  PSP1 domain protein  36.97 
 
 		 410 aa  223  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  0.225055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0039  PSP1 domain protein  42.47 
 
 		 302 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2231  hypothetical protein  43.92 
 
 		 345 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2443  PSP1 domain-containing protein  45.28 
 
 		 301 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0061  PSP1 domain-containing protein  42.2 
 
 		 282 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2758  PSP1 domain-containing protein  45.28 
 
 		 301 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0038  PSP1 domain-containing protein  44.98 
 
 		 270 aa  217  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.214386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1076  PSP1 domain-containing protein  39.93 
 
 		 508 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1663  PSP1 domain-containing protein  39.32 
 
 		 362 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20350  PSP1 domain protein  40.89 
 
 		 288 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0026  PSP1 domain protein  44.03 
 
 		 275 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0057  PSP1 domain-containing protein  43.89 
 
 		 293 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0028  PSP1 domain protein  43.28 
 
 		 275 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2320  PSP1  40.46 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0027  PSP1 domain-containing protein  41.34 
 
 		 275 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0516  PSP1 domain protein  43.92 
 
 		 295 aa  207  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0840264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0041  hypothetical protein  41.34 
 
 		 275 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0037  hypothetical protein  41.34 
 
 		 275 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5279  hypothetical protein  41.34 
 
 		 275 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0037  hypothetical protein  41.34 
 
 		 275 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0506  PSP1 domain-containing protein  41.02 
 
 		 267 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0519  PSP1 domain-containing protein  41.02 
 
 		 267 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.34633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1948  PSP1 domain protein  39.71 
 
 		 364 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.640853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0123  hypothetical protein  41.41 
 
 		 267 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0030  hypothetical protein  41.43 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0031  hypothetical protein  41.43 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0028  signal peptidase-like protein  41.43 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0028  signal peptidase-like protein  41.43 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0029  hypothetical protein  41.43 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1637  PSP1 domain-containing protein  41.63 
 
 		 406 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.293382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2254  PSP1 domain-containing protein  41.63 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0152861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0027  PSP1 domain-containing protein  38.93 
 
 		 275 aa  203  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0124  PSP1 domain protein  45.66 
 
 		 219 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00134499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0102  PSP1 domain protein  41.6 
 
 		 270 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0883281  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3155  PSP1 domain-containing protein  45.58 
 
 		 315 aa  200  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00192464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0155  PSP1 domain-containing protein  39 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3206  PSP1 domain protein  40.32 
 
 		 312 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0232382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1057  PSP1 domain protein  40.32 
 
 		 312 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000216958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0314  PSP1 domain protein  42.41 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3912  PSP1 domain-containing protein  44.21 
 
 		 300 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3465  PSP1 domain-containing protein  41.54 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2118  PSP1 domain protein  46.54 
 
 		 228 aa  196  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0044  Signal peptidase II  43.59 
 
 		 239 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.494362  hitchhiker  0.0000921267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1593  hypothetical protein  41.2 
 
 		 374 aa  193  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.571552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  39.77 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4539  PSP1 domain protein  39.03 
 
 		 275 aa  191  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9214  signal peptidase-like protein  39.37 
 
 		 283 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0043  hypothetical protein  46.54 
 
 		 238 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0062  PSP1 domain protein  46.54 
 
 		 282 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0293146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3205  PSP1 domain-containing protein  38.35 
 
 		 284 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1170  PSP1 domain-containing protein  38.64 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.475432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8391  PSP1 domain protein  39.18 
 
 		 284 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  37.55 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4308  PSP1  36.67 
 
 		 315 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4018  PSP1 domain-containing protein  37.1 
 
 		 277 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.670242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0305  PSP1 domain-containing protein  37.35 
 
 		 345 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.782798  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0790  PSP1 domain protein  38.49 
 
 		 300 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1964  PSP1 domain-containing protein  39.6 
 
 		 277 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1421  PSP1 domain protein  38.89 
 
 		 362 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.703416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6482  PSP1 domain protein  39.73 
 
 		 646 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2253  PSP1 domain protein  35.56 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0410  PSP1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 298 aa  167  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0292  hypothetical protein  31.83 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2937  PSP1 domain protein  38.53 
 
 		 302 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4399  PSP1 domain-containing protein  36.75 
 
 		 277 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0745  PSP1 domain protein  35.02 
 
 		 276 aa  163  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0113  tpl protein  41.87 
 
 		 304 aa  161  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1125  PSP1 domain protein  37.15 
 
 		 266 aa  161  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3600  PSP1 domain protein  35.98 
 
 		 508 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1944  PSP1 domain-containing protein  34.96 
 
 		 278 aa  156  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0237461  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0400  hypothetical protein  34.93 
 
 		 427 aa  156  9e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03465  hypothetical protein  35.86 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1490  PSP1 domain-containing protein  32.49 
 
 		 294 aa  154  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1017  PSP1 domain protein  36.25 
 
 		 404 aa  154  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0528  signaling phosphorelay regulator protein  33.46 
 
 		 268 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0447  signaling phosphorelay regulator protein  37.01 
 
 		 260 aa  152  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0874  PSP1 domain protein  35.83 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0156  PSP1 domain-containing protein  36.13 
 
 		 271 aa  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000326451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0154  PSP1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 271 aa  150  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0038  PSP1 domain protein  39 
 
 		 328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1868  PSP1 domain-containing protein  42.46 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5965  PSP1 domain protein  35.15 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.565053 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0080  PSP1 domain protein  34.58 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.918757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0891  PSP1 domain-containing protein  31.78 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0076  PSP1 domain protein  28.97 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1476  PSP1 domain protein  33.33 
 
 		 462 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.71704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0231  PSP1  32.1 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0647  PSP1 domain protein  33.46 
 
 		 258 aa  137  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2781  hypothetical protein  33.98 
 
 		 268 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1762  PSP1 domain-containing protein  31.76 
 
 		 259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>