More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1084 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 314 aa  640    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  46.33 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  47.56 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2658  ribosomal RNA adenine methylase transferase  43.23 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  40.45 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  37.28 
 
 		 281 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  40.85 
 
 		 302 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  39.37 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  37.28 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  37.98 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  38.28 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  39.65 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  41.28 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  34.09 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  33.99 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  32.79 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  34.23 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  34.04 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 		 600 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  37.63 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  33.99 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  35.84 
 
 		 290 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  33.99 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  37.72 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  32.99 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  38.93 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  35.79 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  33.01 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  34 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  33.68 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  33.01 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  32.68 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  33.44 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  32.35 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  32.35 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  34.2 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.99 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  32.42 
 
 		 285 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  32.42 
 
 		 285 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  33.55 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  38.97 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  32.55 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  34.58 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  35.89 
 
 		 284 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  32.66 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  29.04 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  32.88 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  33.8 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  32.3 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  31.08 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  31.72 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 		 277 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  33.22 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  33.68 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  33.8 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  34.86 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  32.4 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  33.22 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  33.45 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  32.62 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5257  dimethyladenosine transferase  35.87 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  29.47 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  37.72 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  31.46 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  31.63 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  36.01 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>