More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0959 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
311 aa  623  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.92 
 
 
306 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
306 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
306 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
306 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  43.61 
 
 
306 aa  271  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  43.61 
 
 
306 aa  271  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  42.95 
 
 
327 aa  271  9e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.61 
 
 
306 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  42.95 
 
 
306 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
308 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
306 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
306 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
306 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
306 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  42.95 
 
 
306 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
306 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
306 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
306 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
306 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
306 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  43.61 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.61 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  41.04 
 
 
307 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 
306 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
307 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 
306 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
306 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
307 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.95 
 
 
306 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
306 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
306 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
306 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.12 
 
 
306 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.78 
 
 
306 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
311 aa  262  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.97 
 
 
306 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  40.13 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  40.13 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.97 
 
 
306 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  40.13 
 
 
306 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.8 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
306 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.8 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  39.8 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  40.13 
 
 
306 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
315 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  39.47 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
306 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.78 
 
 
305 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
314 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
313 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.46 
 
 
314 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 
333 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  37.18 
 
 
313 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
313 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  40.06 
 
 
313 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
313 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
313 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
313 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.74 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  40.65 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
313 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 
336 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.74 
 
 
336 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
313 aa  240  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
321 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  39.04 
 
 
336 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 
336 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 
321 aa  239  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  38.74 
 
 
336 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
336 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.47 
 
 
336 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
313 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
305 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
318 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
306 aa  239  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
315 aa  238  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.14 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>