277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0954 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  2.8221e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  39.15 
 
 
238 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.24945e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  37.19 
 
 
238 aa  164  1e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  36.51 
 
 
241 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  34.18 
 
 
238 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  41.8 
 
 
231 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  37.1 
 
 
252 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  37.55 
 
 
245 aa  153  3e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  39.15 
 
 
250 aa  153  3e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  43.48 
 
 
233 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.15799e-06  hitchhiker  6.99279e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  38.5 
 
 
233 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  34.31 
 
 
237 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  35.77 
 
 
279 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  39.82 
 
 
298 aa  147  2e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  40.53 
 
 
230 aa  147  2e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  42.11 
 
 
255 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  31.97 
 
 
237 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  39.81 
 
 
244 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.3 
 
 
238 aa  141  1e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  38.18 
 
 
256 aa  141  1e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  33.2 
 
 
242 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  38.61 
 
 
253 aa  134  2e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  38.54 
 
 
250 aa  134  2e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  36.55 
 
 
251 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  35.78 
 
 
273 aa  132  7e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  37.27 
 
 
602 aa  132  7e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  37.6 
 
 
236 aa  131  1e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  32.66 
 
 
312 aa  131  1e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  34.71 
 
 
253 aa  130  2e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  34.13 
 
 
268 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  32.4 
 
 
274 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  38.25 
 
 
242 aa  129  4e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  34.52 
 
 
238 aa  129  4e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  38.01 
 
 
272 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  36.98 
 
 
248 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  38.76 
 
 
262 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  33.86 
 
 
278 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  33.86 
 
 
278 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  35.32 
 
 
253 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37.89 
 
 
241 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.0649e-07  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  31.73 
 
 
279 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  31.73 
 
 
279 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  38.83 
 
 
237 aa  121  1e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  34.84 
 
 
247 aa  121  1e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  36.67 
 
 
238 aa  121  1e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  31.45 
 
 
268 aa  121  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  32.64 
 
 
261 aa  120  2e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  31.05 
 
 
268 aa  119  4e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.41 
 
 
242 aa  119  4e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  37.24 
 
 
252 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
238 aa  118  8e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  31.73 
 
 
268 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  33.95 
 
 
285 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  31.33 
 
 
279 aa  118  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  36.11 
 
 
297 aa  117  2e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  35.02 
 
 
254 aa  117  2e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  34.65 
 
 
256 aa  117  2e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.55544e-05 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  34.01 
 
 
255 aa  117  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  32.22 
 
 
279 aa  116  4e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  35.54 
 
 
222 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  31.4 
 
 
268 aa  115  9e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  32.88 
 
 
245 aa  114  1e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  3.41197e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  36.45 
 
 
266 aa  114  1e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  39.78 
 
 
233 aa  115  1e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  33.93 
 
 
250 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  34.07 
 
 
229 aa  114  2e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.33 
 
 
259 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  34.57 
 
 
240 aa  114  2e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  34.58 
 
 
259 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  35.65 
 
 
256 aa  114  2e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  32.49 
 
 
259 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.48 
 
 
250 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  31.19 
 
 
264 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.48 
 
 
250 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  37.37 
 
 
231 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  34.76 
 
 
264 aa  112  4e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.48 
 
 
254 aa  113  4e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.48 
 
 
254 aa  113  4e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  35.91 
 
 
244 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  33.48 
 
 
250 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  34.39 
 
 
253 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.02 
 
 
254 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  34.29 
 
 
235 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  34.1 
 
 
250 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  31.8 
 
 
262 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  35.02 
 
 
254 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  31.8 
 
 
261 aa  112  7e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  31.63 
 
 
240 aa  112  8e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  39.09 
 
 
250 aa  112  8e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  31.8 
 
 
261 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  30.29 
 
 
264 aa  111  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  35.64 
 
 
493 aa  111  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  31.8 
 
 
261 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  36.95 
 
 
240 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  36.95 
 
 
240 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  35.6 
 
 
243 aa  110  2e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  34.56 
 
 
254 aa  110  2e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  36.95 
 
 
251 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  34.56 
 
 
254 aa  110  2e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  32.86 
 
 
231 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>