207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0896 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0896  amidohydrolase-like protein  100 
 
 
595 aa  1217  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000474495  normal  0.217334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  24.7 
 
 
591 aa  111  4e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  23.44 
 
 
584 aa  110  7e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  23.53 
 
 
543 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  23.87 
 
 
583 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  24.13 
 
 
545 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  23.02 
 
 
560 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  24 
 
 
565 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  23.69 
 
 
566 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  23.99 
 
 
565 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  24.38 
 
 
570 aa  95.5  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  22.71 
 
 
565 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  23.81 
 
 
556 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  25.31 
 
 
554 aa  91.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  20.54 
 
 
546 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  25.6 
 
 
549 aa  90.5  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  25.6 
 
 
549 aa  90.5  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  22.45 
 
 
569 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  22.67 
 
 
577 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.23 
 
 
597 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  22.45 
 
 
569 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  22.58 
 
 
561 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  21.89 
 
 
553 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  23.05 
 
 
590 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  24.03 
 
 
599 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  22.4 
 
 
561 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  21.31 
 
 
542 aa  87.4  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  21.31 
 
 
542 aa  87.4  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  22.56 
 
 
540 aa  87  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  21.28 
 
 
538 aa  86.3  1e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  24.62 
 
 
567 aa  85.9  2e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  24.66 
 
 
571 aa  85.5  2e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  24.95 
 
 
548 aa  86.3  2e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  23.84 
 
 
571 aa  85.5  3e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.52 
 
 
535 aa  84.7  4e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  24.24 
 
 
542 aa  84  7e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  22.2 
 
 
567 aa  84  8e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  24.37 
 
 
558 aa  83.2  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  22.28 
 
 
567 aa  82.8  1e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.51 
 
 
537 aa  82.8  2e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  21.15 
 
 
526 aa  81.6  3e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  21.55 
 
 
538 aa  82  3e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  21.78 
 
 
565 aa  82  3e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  20.45 
 
 
576 aa  81.3  5e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  22.77 
 
 
561 aa  80.5  8e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  24.42 
 
 
556 aa  80.5  8e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  24.78 
 
 
554 aa  80.5  8e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  22.77 
 
 
561 aa  80.5  9e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  22.1 
 
 
540 aa  79.7  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  22.1 
 
 
540 aa  79.7  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  22.16 
 
 
539 aa  80.1  1e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  24.76 
 
 
564 aa  79.7  1e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.35 
 
 
543 aa  79  2e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  21.92 
 
 
540 aa  79.7  2e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  27.76 
 
 
539 aa  79.7  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  25 
 
 
577 aa  79  3e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  21.37 
 
 
575 aa  78.6  3e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  20.63 
 
 
576 aa  78.6  3e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  22.32 
 
 
562 aa  78.2  4e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  22.77 
 
 
566 aa  77.8  5e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  24.18 
 
 
556 aa  77.4  6e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  22.56 
 
 
536 aa  77.4  7e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  25.63 
 
 
552 aa  77.4  7e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  23.98 
 
 
538 aa  77  8e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  24.47 
 
 
567 aa  76.6  1e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  21.67 
 
 
540 aa  76.3  2e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  23.65 
 
 
586 aa  75.9  2e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  21.75 
 
 
601 aa  75.5  3e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  23.88 
 
 
565 aa  75.1  3e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  22.95 
 
 
572 aa  75.5  3e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  22.95 
 
 
572 aa  75.5  3e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.01 
 
 
577 aa  75.5  3e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  22.28 
 
 
552 aa  74.7  4e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  22.63 
 
 
536 aa  74.7  4e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  22.25 
 
 
572 aa  75.1  4e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  22.89 
 
 
573 aa  75.1  4e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  29.19 
 
 
576 aa  74.7  4e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  21.47 
 
 
566 aa  73.9  7e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  21.75 
 
 
566 aa  74.3  7e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  25.07 
 
 
559 aa  73.9  8e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  23.61 
 
 
558 aa  73.6  9e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  22.39 
 
 
611 aa  73.6  1e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0822  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  18.25 
 
 
505 aa  73.2  1e-11  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  23.06 
 
 
576 aa  73.2  1e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  22.87 
 
 
554 aa  73.2  1e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  22.92 
 
 
550 aa  73.2  1e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  24.13 
 
 
583 aa  72.4  2e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  24.12 
 
 
562 aa  72.8  2e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  23.2 
 
 
583 aa  72.8  2e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  22.25 
 
 
545 aa  72.4  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  24.93 
 
 
557 aa  72  3e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  21.63 
 
 
561 aa  72  3e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  23.03 
 
 
546 aa  71.2  4e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  21.39 
 
 
566 aa  71.2  4e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  23.29 
 
 
566 aa  71.2  5e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  32.08 
 
 
568 aa  71.2  5e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  22.39 
 
 
545 aa  70.9  6e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  21.77 
 
 
573 aa  70.5  8e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  22.69 
 
 
554 aa  70.5  9e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  23.15 
 
 
545 aa  70.1  1e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>