75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0880 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  30.49 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  29.93 
 
 		 326 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  30.5 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.4 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  27.21 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  26.76 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  26.64 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  27.24 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  25.78 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  33.86 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  36.11 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  25 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  26.86 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  26.32 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  25.11 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  29.83 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  28.86 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  28.78 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  28.96 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  30.15 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  26.99 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  26.21 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  24.2 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  23.96 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  27.51 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  34.85 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  25.58 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  25.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  25.58 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  27.83 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  31.4 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  26.24 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  28 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  23.18 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  32.64 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  27.61 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  29.24 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  29.87 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  25.33 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  28.95 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  34.92 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  25.47 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  33.64 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  23.35 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  30.34 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  32.31 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1850  CAAX amino terminal protease family protein  28.78 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0460286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  29.52 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  39.08 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  33.98 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  29.21 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  28.29 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  32.29 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  32.04 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0142  abortive infection protein  30.3 
 
 		 509 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000324505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  29.21 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  25.93 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  38.04 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  34.74 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  34.74 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  34.74 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  29.52 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  29.71 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5144  CAAX amino terminal protease family protein  30.34 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  27.13 
 
 		 285 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  32.58 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  27.63 
 
 		 458 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>