32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0873 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  100 
 
 
376 aa  747    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  35.44 
 
 
343 aa  109  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  33.49 
 
 
355 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  31.63 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  31.16 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  31.16 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  31.16 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  30.7 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  24.69 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  29.56 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  24.38 
 
 
339 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  25.54 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  28.86 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  26.1 
 
 
331 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  26.1 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  26.1 
 
 
331 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  30.12 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  32.47 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  29.52 
 
 
331 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  25.51 
 
 
331 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  25.51 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  27.71 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  27.71 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  29.27 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  27.71 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  27.71 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  27.71 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1856  acyltransferase 3  31.43 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  22.95 
 
 
337 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  27.11 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  29.66 
 
 
330 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  28.97 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>