More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0849 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  100 
 
 
459 aa  928    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.45 
 
 
470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  69.21 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.98 
 
 
478 aa  571  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  54.09 
 
 
446 aa  484  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  53.88 
 
 
443 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  56 
 
 
453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  55.26 
 
 
448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.7 
 
 
446 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  53.12 
 
 
446 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.16 
 
 
447 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  52.08 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  52.3 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.85 
 
 
449 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  51.38 
 
 
451 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  53.99 
 
 
445 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.39 
 
 
449 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.61 
 
 
449 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  52.25 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  53.97 
 
 
450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  52.64 
 
 
446 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  51.38 
 
 
449 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  53.61 
 
 
443 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  49.78 
 
 
455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.89 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  51.38 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  53.07 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  51.84 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  50.46 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.05 
 
 
444 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.83 
 
 
444 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.67 
 
 
447 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  53.29 
 
 
522 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  53.24 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.27 
 
 
528 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  50.32 
 
 
479 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  51.13 
 
 
440 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  48.25 
 
 
455 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  50.23 
 
 
439 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  53.76 
 
 
452 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  48.25 
 
 
455 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  52.72 
 
 
452 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  52.72 
 
 
452 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.4 
 
 
450 aa  431  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  52.55 
 
 
524 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.72 
 
 
523 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  51.11 
 
 
535 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.66 
 
 
443 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  48.78 
 
 
446 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  49.89 
 
 
518 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  49.24 
 
 
445 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  50 
 
 
527 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  48.33 
 
 
439 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.11 
 
 
529 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.97 
 
 
515 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  49.3 
 
 
433 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  50.12 
 
 
435 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  49.44 
 
 
454 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  52.31 
 
 
528 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.22 
 
 
452 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  50.23 
 
 
531 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  49.07 
 
 
433 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
508 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50 
 
 
492 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  51.51 
 
 
518 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  49.66 
 
 
441 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  48.64 
 
 
449 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.88 
 
 
454 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  51.89 
 
 
519 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.04 
 
 
443 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  51.74 
 
 
444 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  50.57 
 
 
517 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.92 
 
 
551 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  50.11 
 
 
522 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  49.23 
 
 
452 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  51.04 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  49.16 
 
 
525 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.91 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  49.88 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  49.65 
 
 
512 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  51.97 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  52.06 
 
 
525 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  50 
 
 
521 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  47.14 
 
 
476 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  48.91 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.57 
 
 
527 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.65 
 
 
604 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  52.61 
 
 
514 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  48.46 
 
 
449 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.14 
 
 
520 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.14 
 
 
520 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>