52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0846 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 559 aa  1150    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.33 
 
 		 498 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.71 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.04 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  31.05 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  31.4 
 
 		 514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.61 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0040  hypothetical protein  24.68 
 
 		 464 aa  101  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  22.05 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  20.49 
 
 		 498 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  22.55 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  22.05 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  22.06 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  21.66 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  21.66 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  20.28 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  24.9 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  20 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  28.71 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.63 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.56 
 
 		 866 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  23.57 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2614  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.69 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000221676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.23 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.57 
 
 		 376 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.24 
 
 		 206 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.77 
 
 		 370 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  32.54 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.79 
 
 		 261 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.89 
 
 		 374 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  30.95 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  31.75 
 
 		 496 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  31.75 
 
 		 503 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.91 
 
 		 177 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.67 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  25.69 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.01 
 
 		 171 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1054  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.69 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  30.95 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.09 
 
 		 413 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.01 
 
 		 201 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  31.75 
 
 		 455 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2157  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.58 
 
 		 171 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.48 
 
 		 170 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28770  hypothetical protein  34.78 
 
 		 399 aa  43.9  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.132574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  30.46 
 
 		 537 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1292  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.82 
 
 		 395 aa  43.9  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.713325  normal  0.77426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11462  hypothetical protein  29.37 
 
 		 271 aa  43.5  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.891259 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  22.24 
 
 		 531 aa  43.5  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>