More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0802 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  75.58 
 
 		 162 aa  125  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 167 aa  99.4  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  60.92 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 172 aa  94.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  70.93 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  61.9 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  62.96 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  62.65 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  60.49 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  58.14 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  56.79 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  60.76 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  58.33 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  59.49 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  58.44 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  59.26 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  55.81 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  52.38 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  45.24 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.45 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>