More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0781 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  100 
 
 		 165 aa  328  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  52.29 
 
 		 371 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  51.55 
 
 		 408 aa  144  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  42.95 
 
 		 159 aa  134  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  45.96 
 
 		 436 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  48.23 
 
 		 208 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  45.12 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  45.22 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  42.04 
 
 		 408 aa  121  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  41.98 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  45.78 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  44.24 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  44.51 
 
 		 422 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  44.72 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  41.92 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  46.48 
 
 		 420 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  47.1 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  48.55 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  47.52 
 
 		 203 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  41.32 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 412 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  41.32 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  42.86 
 
 		 401 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  41.32 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  43.59 
 
 		 400 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  46.85 
 
 		 423 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  44.68 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  44.51 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  40.72 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  41.67 
 
 		 218 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  43.97 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  44.93 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  40.61 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  46.81 
 
 		 211 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  46.53 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  44.83 
 
 		 163 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  46.88 
 
 		 423 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  46.53 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  43.31 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  46.48 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  40.85 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  46.53 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  42.5 
 
 		 208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  43.31 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  42.96 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  47.62 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  42.36 
 
 		 403 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  41.96 
 
 		 413 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 415 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  43.14 
 
 		 415 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  43.48 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  41.91 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  45.16 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  44.51 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  39.52 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  45.27 
 
 		 411 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3262  CinA-like  46.05 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  40.74 
 
 		 206 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  44.67 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  41.61 
 
 		 408 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  45.19 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  41.77 
 
 		 408 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  47.48 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 		 430 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  38.32 
 
 		 414 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  45.93 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  45.19 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  40.12 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  39.16 
 
 		 408 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  42.86 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  45.93 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  45.93 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  41.4 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  42.42 
 
 		 421 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  48.55 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  46.48 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  42.42 
 
 		 421 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  43.05 
 
 		 419 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  42.42 
 
 		 421 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  45.93 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  42.77 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  42.22 
 
 		 411 aa  107  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  43.24 
 
 		 420 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  41.14 
 
 		 408 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  50 
 
 		 426 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  37.58 
 
 		 413 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  42.18 
 
 		 364 aa  107  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  43.56 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  41.14 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 438 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  39.63 
 
 		 422 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  43.75 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>