139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0777 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  65.69 
 
 		 513 aa  690    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 517 aa  1031    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  64.12 
 
 		 510 aa  676    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  64.73 
 
 		 525 aa  652    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  53.71 
 
 		 512 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  52.05 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  53.23 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  53.4 
 
 		 487 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  53.29 
 
 		 511 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.39 
 
 		 521 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.71 
 
 		 518 aa  534  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  53.29 
 
 		 511 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  56.04 
 
 		 509 aa  535  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  52.41 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.07 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  52.87 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  51.83 
 
 		 518 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 520 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 520 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 520 aa  521  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 520 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  52.15 
 
 		 515 aa  524  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  51.94 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 521 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 520 aa  521  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  52.35 
 
 		 514 aa  525  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  52.22 
 
 		 518 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  52.15 
 
 		 520 aa  518  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  52.51 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  52.22 
 
 		 520 aa  518  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  52.42 
 
 		 521 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  52.22 
 
 		 521 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  52.61 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  52.66 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  51.26 
 
 		 520 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  52.22 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  53.53 
 
 		 504 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  51.97 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  51.54 
 
 		 524 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  49.06 
 
 		 533 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  48.87 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  48.56 
 
 		 527 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  50.48 
 
 		 519 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.74 
 
 		 516 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  51.43 
 
 		 519 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  51.43 
 
 		 519 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.13 
 
 		 520 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  49.15 
 
 		 540 aa  497  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  52.23 
 
 		 521 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  49.23 
 
 		 521 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  47.9 
 
 		 519 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  50.77 
 
 		 521 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  51.75 
 
 		 519 aa  488  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 537 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  56.44 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  47.78 
 
 		 519 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  47.78 
 
 		 519 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  51.72 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  46.42 
 
 		 527 aa  478  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.4 
 
 		 523 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  50.1 
 
 		 535 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  48.82 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  54.95 
 
 		 487 aa  478  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  50.6 
 
 		 531 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  45.84 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  49.59 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  55.68 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  46.03 
 
 		 527 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  52.04 
 
 		 507 aa  472  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.71 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  47.17 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  45.66 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  47.84 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  45.87 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  46.95 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  47.65 
 
 		 516 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.6 
 
 		 560 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  52.39 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  45.61 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  49.28 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 		 530 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  48.54 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  44.7 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  44.47 
 
 		 522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  44.38 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1221  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.42 
 
 		 533 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  52.18 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  44.73 
 
 		 523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  47.07 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.23 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3523  metal dependent phosphohydrolase  49.49 
 
 		 646 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.555023  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.19 
 
 		 527 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  53.23 
 
 		 501 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  45.35 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3992  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  55.67 
 
 		 610 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.748921  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  49.78 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  45.82 
 
 		 546 aa  435  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  42.69 
 
 		 522 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>