More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0772 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 437 aa  881    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  56.14 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  54.2 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  49.19 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.8 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.78 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.99 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  45.31 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  43.06 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  42.06 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.83 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.52 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  43.22 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  42.58 
 
 		 502 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  42.38 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  42.24 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  42.12 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.34 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  41.18 
 
 		 512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.2 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  41.3 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.2 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  41.15 
 
 		 521 aa  302  9e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  43.6 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  44.53 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  42.59 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  42.59 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.75 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  42.35 
 
 		 483 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  48.62 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  48.19 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  48.19 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  40.24 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  42.18 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.95 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  40.75 
 
 		 515 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  44.31 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  41.73 
 
 		 501 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  41.13 
 
 		 494 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  47.01 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  46.8 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  44.7 
 
 		 426 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  40.9 
 
 		 522 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  40.76 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  42.59 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.31 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  41.75 
 
 		 515 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  41.56 
 
 		 493 aa  293  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.95 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  49.84 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.93 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  44.55 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  45.74 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  42.11 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  47.74 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 553 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  41.91 
 
 		 546 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  43.18 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.29 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  47.74 
 
 		 392 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  40 
 
 		 519 aa  290  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  47.74 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  47.74 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  47.74 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  47.74 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  47.74 
 
 		 387 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  41.38 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  47.8 
 
 		 426 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  42.04 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  39.72 
 
 		 530 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  39.53 
 
 		 501 aa  289  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  42.93 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  42.93 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  44.8 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  44.8 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  42.93 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  45.05 
 
 		 425 aa  289  8e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  47.74 
 
 		 387 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  48.27 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  44.8 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.17 
 
 		 596 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  44.55 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  44.8 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.31 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  40.71 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  48.95 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  48.31 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  41.63 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  48.31 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.86 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  42.34 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.49 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  47.37 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  48.31 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  43.43 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  43.43 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  43.43 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>