More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0765 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 316 aa  639    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.23 
 
 		 555 aa  275  7e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.84 
 
 		 556 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  45.21 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  44.3 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  44.12 
 
 		 552 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  43.93 
 
 		 555 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  43.75 
 
 		 547 aa  256  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  43 
 
 		 638 aa  255  7e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  43.95 
 
 		 409 aa  251  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  44.12 
 
 		 304 aa  251  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  42.26 
 
 		 569 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  41.31 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.98 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  43.37 
 
 		 308 aa  245  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  45.75 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  41.48 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40.82 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 396 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  46.38 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.3 
 
 		 427 aa  235  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  41.12 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  41.45 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  39.3 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  39.68 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  39.55 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  39.56 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  39.56 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  39.62 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  39.56 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  39.56 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 317 aa  231  9e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 321 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.13 
 
 		 321 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.13 
 
 		 321 aa  231  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  42.21 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  39.56 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  41.12 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  41.18 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  40 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  40.66 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  41.23 
 
 		 340 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 308 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  42.63 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  42.41 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  39.24 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  42.48 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  40.82 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  41.86 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  40.72 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  40.72 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  41.35 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 327 aa  225  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 321 aa  225  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40.46 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  39.03 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  39.3 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  41.64 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  41.78 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 346 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 336 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  40 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  40.38 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  41.35 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  41.9 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  41.9 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  37.22 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  38.82 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  39.39 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  39.47 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  41.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  41.29 
 
 		 359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.53 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  40.26 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  39.14 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  40.63 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  39.54 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.94 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  40.38 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  41.85 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  40.82 
 
 		 329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  38.44 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  41.03 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  39.37 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>