116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0759 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  60.75 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  57.22 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1356  protein of unknown function UPF0157  44.74 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  47.4 
 
 		 347 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  32.43 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 601 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  29.07 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  35.44 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  30.95 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  29.59 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  30.72 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  29.76 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  30.72 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  28.92 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  30.91 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  30.43 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  32.18 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  34.46 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  32.74 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  31.1 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  31.1 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  31.55 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  31.14 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  27.11 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  28.65 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  32.86 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  27.47 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  29.27 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06714  hypothetical protein  27.61 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  29.05 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  30.2 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  28.66 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  31.01 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  29.27 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  30.19 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  30.6 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  25.42 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  29.56 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  28.66 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  31.25 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  29.27 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  27.75 
 
 		 365 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  29.07 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  27.65 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  32.61 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  27.91 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  28.4 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  27.12 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  27.53 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  30.61 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  28.66 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  26.16 
 
 		 402 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  34.35 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  27.22 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  27.38 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.29 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.29 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  25.88 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  31.58 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  26.35 
 
 		 406 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  30.88 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  22.64 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  29.65 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  26.04 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  26.47 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  32.56 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  32.56 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4039  protein of unknown function UPF0157  29.8 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  27.71 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  27.61 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  31.76 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  26.06 
 
 		 318 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  26.88 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  27.88 
 
 		 375 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12970  hypothetical protein  28.65 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  28.24 
 
 		 392 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3535  protein of unknown function UPF0157  25.71 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  24.84 
 
 		 318 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2187  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  28.06 
 
 		 354 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3031  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.79 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000100967  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05567  GrpB domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01530)  31.54 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.68777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>