More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0724 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.47 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  29.44 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  28.89 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  28.89 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  28.89 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  28.89 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  29.05 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  27.22 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.66 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.47 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.47 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.47 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.41 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.26 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  25.42 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 378 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.22 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  26.27 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.62 
 
 		 382 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.78 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  27.47 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.21 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  26.62 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  28.34 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  27.98 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  26.57 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  25.81 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 		 203 aa  62  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  24.72 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  24.47 
 
 		 203 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.72 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.72 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  26.86 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.41 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.47 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  24.85 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  28.24 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  34.94 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>