More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0706 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 290 aa  590  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.98 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  57.44 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  47.42 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  48.79 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  48.44 
 
 		 303 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.9 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 288 aa  225  8e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 288 aa  222  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  45.14 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43.45 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  41.64 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  46.37 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  42.71 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  40.75 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  41.58 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  43.6 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  41.69 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  39.53 
 
 		 313 aa  208  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  41.26 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  41.06 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  42.66 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.52 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  41.81 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  41.78 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  40 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  46.44 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  45.32 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  42.66 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  40.96 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.91 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  42.21 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  43.6 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  42.56 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  42.56 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  42.56 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  40.46 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  40.91 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  42.21 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  42.21 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  41.1 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  39.8 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  41.7 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  39.51 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  40.83 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  36.82 
 
 		 314 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  39.12 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  40.94 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  38.81 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.72 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  38.33 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  40.28 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  37.16 
 
 		 308 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  45.25 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  40 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  40.97 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.21 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  39.32 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  44.87 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  41.32 
 
 		 295 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  40.2 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  38.98 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  37.76 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  37.59 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1743  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  44.15 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  44.15 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>