272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0700 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  37.72 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  41.18 
 
 		 123 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  41.8 
 
 		 116 aa  88.6  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  40.16 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.76 
 
 		 125 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.34 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  40.54 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.72 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  38.52 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  38.6 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  41.53 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  37.29 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  39.06 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  38.98 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  35.09 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  40.94 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  39.83 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  38.89 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  36.89 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0937  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.04 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  36.54 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  36.92 
 
 		 132 aa  73.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  34.43 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  39.18 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  39.82 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  39.64 
 
 		 117 aa  72  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  36.97 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  36.11 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  36.97 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  33.04 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  39.05 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  35.94 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.89 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  39 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0325  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  39.32 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  34.19 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  33.62 
 
 		 117 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  36.43 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  30.51 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  33.06 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  39.42 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  38.1 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  31.31 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  38.21 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  35.25 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  37.38 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  40.38 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  35.92 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  36.19 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  35.51 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  35.04 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  36.59 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  37.37 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3870  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3919  protein of unknown function UPF0102  38.24 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000143067  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  39.29 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  47.27 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0116  hypothetical protein  38.05 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  34.45 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  35.43 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0146  hypothetical protein  34.96 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1324  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  49.09 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  36.73 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  35.2 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  37.1 
 
 		 129 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  36.84 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  39.25 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  35.85 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  36.13 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  35.14 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  32.77 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  36.11 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  31.09 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  32.76 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  30.83 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0181  hypothetical protein  36.59 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  35.64 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  35.2 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  36.45 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>