More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0673 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 669 aa  1377    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  46.38 
 
 		 716 aa  528  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  38.78 
 
 		 709 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  40.97 
 
 		 724 aa  415  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 		 647 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 		 645 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 687 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 		 643 aa  311  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  34.01 
 
 		 640 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 		 639 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  32.21 
 
 		 646 aa  291  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 		 646 aa  290  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 678 aa  288  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 634 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 		 642 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  31.17 
 
 		 670 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  31.65 
 
 		 697 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  33.38 
 
 		 667 aa  276  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  31.32 
 
 		 775 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 664 aa  274  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 		 662 aa  272  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  29.99 
 
 		 655 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 691 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 		 686 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 619 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.88 
 
 		 619 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 		 658 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 		 716 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  29.76 
 
 		 661 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 		 667 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 		 618 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  30.78 
 
 		 655 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  30.42 
 
 		 630 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.35 
 
 		 629 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 		 631 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.09 
 
 		 574 aa  260  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 630 aa  259  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 		 644 aa  259  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.51 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  31.29 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 		 600 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.39 
 
 		 629 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 		 610 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 		 629 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 		 631 aa  257  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 645 aa  257  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 629 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 648 aa  257  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 610 aa  256  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 		 636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 729 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 633 aa  253  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 		 764 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 		 609 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.64 
 
 		 617 aa  253  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 630 aa  253  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 617 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 630 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 		 627 aa  252  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 		 618 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 		 600 aa  251  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.14 
 
 		 681 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  29.63 
 
 		 588 aa  251  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 		 709 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  32.68 
 
 		 701 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  32.11 
 
 		 640 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 		 596 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 		 703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  29.83 
 
 		 618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  30.64 
 
 		 691 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  28.84 
 
 		 633 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  28.84 
 
 		 633 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  28.84 
 
 		 633 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 607 aa  243  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 		 681 aa  243  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  28.84 
 
 		 633 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  28.84 
 
 		 633 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 708 aa  243  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  31.31 
 
 		 597 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  30.02 
 
 		 631 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 		 640 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  27.31 
 
 		 638 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 		 650 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 		 671 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 673 aa  242  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  28.93 
 
 		 631 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.34 
 
 		 641 aa  241  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 		 605 aa  241  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 		 646 aa  241  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 631 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 		 648 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 629 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  29.84 
 
 		 611 aa  240  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  31.89 
 
 		 613 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  29.44 
 
 		 647 aa  239  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  28.55 
 
 		 633 aa  239  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>