More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0570 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  100 
 
 		 140 aa  293  8e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  73.33 
 
 		 150 aa  220  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  64.79 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  58.94 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  56.08 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  69.16 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  59.81 
 
 		 165 aa  143  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 157 aa  103  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  34.31 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  35 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  33.57 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20180  single-stranded DNA-binding protein  43.16 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0170595  normal  0.0624754 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.11 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  35.25 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  31.21 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  32.79 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  35.61 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  36.7 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  34.06 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  38.33 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  34.01 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  39.09 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  39.05 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  40 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 184 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  36.22 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  34.97 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  29.53 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  32.85 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  39 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  39 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  38.39 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  30.71 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  34.56 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  39 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  39 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  35.45 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  33.85 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  28.68 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  28.47 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  34.4 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  29.6 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  31.65 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.57 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  28.67 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  29.52 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>