86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0554 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  37.14 
 
 
264 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  34.02 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  41.76 
 
 
263 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  33.19 
 
 
239 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  31.87 
 
 
256 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  35.35 
 
 
259 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  33.8 
 
 
244 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  30.35 
 
 
257 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  30.31 
 
 
267 aa  102  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  35.37 
 
 
197 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  33.7 
 
 
244 aa  102  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  34.69 
 
 
184 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  30.08 
 
 
261 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  34.59 
 
 
283 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  34.59 
 
 
283 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  52.38 
 
 
193 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  48.91 
 
 
217 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  30.77 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  32.31 
 
 
284 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  37.93 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  47.12 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  44.66 
 
 
252 aa  89  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  43.31 
 
 
172 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  47 
 
 
134 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  39.72 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  38.32 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  30.4 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  39.57 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  30.88 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  45.92 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  40.5 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  49.44 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  35.94 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  46.15 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  39.09 
 
 
140 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  39.09 
 
 
140 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  37.61 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  40.4 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  35.34 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  45.05 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  37.23 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  48.39 
 
 
188 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  37.61 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  37.75 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  37.68 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  29.63 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  40 
 
 
535 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  40 
 
 
535 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2805  prophage antirepressor-like  46.43 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0292574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  35.09 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  40 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  43.01 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  31.14 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  33.55 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  36.61 
 
 
180 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  38.14 
 
 
192 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  34.04 
 
 
204 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  36.61 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  42.67 
 
 
101 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  40.96 
 
 
149 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  38.02 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  34.21 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  35.77 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  31.07 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  53.66 
 
 
58 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3107  prophage antirepressor  31.25 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0568  prophage antirepressor  31.25 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.762577  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3546  BRO-like  29.81 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3552  BRO-like  29.81 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.1258 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  31.96 
 
 
262 aa  52.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0855  prophage antirepressor  25.1 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0871  BRO domain-containing protein  25.1 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  28.16 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3087  prophage antirepressor  33.64 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3698  prophage antirepressor  36.99 
 
 
120 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  30.85 
 
 
170 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0902  prophage antirepressor  35.71 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  25.69 
 
 
245 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2622  BRO domain-containing protein  30.21 
 
 
205 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000919421  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1196  prophage antirepressor  29.79 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  30.21 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  31.82 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  30.38 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  30.12 
 
 
181 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0139  BRO domain-containing protein  25.18 
 
 
191 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.598761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>