More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0523 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  130  8e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  2.50837e-08  unclonable  2.65454e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  65.08 
 
 
65 aa  87  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.64492e-06  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  69.84 
 
 
65 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  65.08 
 
 
65 aa  84  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  5.71086e-06  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  60.34 
 
 
65 aa  74.7  4e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.87397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  65.52 
 
 
65 aa  72  3e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  2.90331e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  72 
 
 
64 aa  71.6  4e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
65 aa  71.2  5e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.59393e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  64.81 
 
 
65 aa  70.1  9e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  3.7882e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  64.81 
 
 
65 aa  70.1  9e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  9.05032e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  62.96 
 
 
65 aa  69.3  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.18579e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
65 aa  68.2  3e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  57.63 
 
 
65 aa  67.8  4e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  57.63 
 
 
65 aa  67.8  4e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  56.67 
 
 
65 aa  67.8  5e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.90106e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  67.4  6e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  61.11 
 
 
65 aa  67  7e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  66.6  1e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.9252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 
64 aa  65.5  2e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.60763e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  57.41 
 
 
65 aa  65.5  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.88111e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  55.17 
 
 
79 aa  65.9  2e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  64.7  4e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.48702e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  63.46 
 
 
65 aa  64.3  5e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  2.76792e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  62.96 
 
 
63 aa  64.3  5e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  58.18 
 
 
65 aa  64.3  5e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  63.5  9e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.96271e-12  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.29882e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  8.04213e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  6.41004e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.35188e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  57.41 
 
 
65 aa  63.2  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.61072e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.18772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.23504e-07  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.0404e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.53199e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.31876e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
64 aa  62.8  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  62  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  55.17 
 
 
65 aa  62.8  2e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  62 
 
 
57 aa  62.4  2e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.12539e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  52.38 
 
 
64 aa  62.4  2e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  62  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.43202e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 
65 aa  61.2  4e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
66 aa  61.2  4e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  1.43813e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  61.2  4e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 
65 aa  61.2  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  56.9 
 
 
64 aa  61.2  5e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 
65 aa  61.2  5e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  56.36 
 
 
68 aa  60.8  6e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  1.82997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
66 aa  60.1  1e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  6.08449e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 
65 aa  59.7  1e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  59.7  1e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  52.54 
 
 
66 aa  59.7  1e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  57.41 
 
 
65 aa  59.7  1e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.39111e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
66 aa  60.1  1e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  6.17441e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  50.85 
 
 
64 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
64 aa  58.9  2e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 
64 aa  59.3  2e-08  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  4.16006e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  51.72 
 
 
64 aa  58.9  2e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.45 
 
 
66 aa  58.9  2e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
64 aa  58.9  3e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  58.5  3e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  58.5  3e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  47.62 
 
 
64 aa  58.5  3e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.2  3e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
64 aa  58.2  4e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
66 aa  58.2  4e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.56581e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 
65 aa  58.2  4e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 
64 aa  58.2  4e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 
67 aa  57.8  5e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 
64 aa  57.8  5e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 
67 aa  57.8  5e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  5e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  57.8  5e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  4.157e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  5e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 
65 aa  57.4  6e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 
65 aa  57.4  6e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  57.4  7e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  57.4  7e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 
67 aa  57  9e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  56.6  1e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  56.2  1e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.50634e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  55.17 
 
 
64 aa  55.8  2e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.92427e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
63 aa  55.8  2e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  44.44 
 
 
64 aa  55.8  2e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  52.73 
 
 
65 aa  55.8  2e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  55.8  2e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  44.44 
 
 
63 aa  55.8  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  49.09 
 
 
64 aa  55.5  3e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  49.09 
 
 
66 aa  55.1  3e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  1.90573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
63 aa  55.1  3e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
64 aa  54.7  4e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>