More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0513 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 383 aa  792    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  52.51 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  43.63 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  41.58 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  39.63 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  41.42 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 388 aa  265  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  40.58 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 		 387 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  39.69 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  39.79 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  40.8 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  39.68 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  39.42 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 393 aa  255  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  39.68 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  39.68 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  39.68 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  39.68 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  39.68 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  39.16 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  39.31 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  42.22 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  40.11 
 
 		 399 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.18 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  39.44 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  39.42 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  40.32 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  40.81 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  38.17 
 
 		 385 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  40.74 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  36.76 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  37.6 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  37.01 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  38.02 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  36.48 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  37.86 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  38.68 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  37.74 
 
 		 392 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  37.9 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  38.34 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  37.03 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  36.71 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  37.46 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  35.68 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  37.92 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  36.49 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  35.42 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  36.95 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  36.91 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  35.56 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  36.49 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  36.55 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  36.81 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  35.83 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  37.05 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  37.09 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  33.52 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  36.81 
 
 		 387 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  36.81 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  35.68 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  36.81 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  35.59 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  36.55 
 
 		 387 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  36.55 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  36.1 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  37.18 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  35.92 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  36.87 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  36.77 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  35.95 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  37.39 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  36.55 
 
 		 387 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  36.55 
 
 		 387 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  37.29 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  36.63 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  36.86 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  37.54 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  36.9 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  36.9 
 
 		 387 aa  225  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  34.9 
 
 		 394 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  34.83 
 
 		 375 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  36.1 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  37.64 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  37.15 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.56 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  34.25 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  34.96 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  35.68 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  36.29 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  38.81 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  36.06 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  35.17 
 
 		 387 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>