More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0396 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  62.15 
 
 
287 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  58.33 
 
 
288 aa  348  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  57.14 
 
 
288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.669513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  57.14 
 
 
288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.626031  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  54.61 
 
 
293 aa  317  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  54.45 
 
 
293 aa  317  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  56.21 
 
 
296 aa  309  4e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.17 
 
 
297 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  53.02 
 
 
298 aa  302  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0238  fructose-bisphosphate aldolase  53.41 
 
 
288 aa  301  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0467  fructose/tagatose bisphosphate aldolase  50.53 
 
 
305 aa  290  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0246198  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0701  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.96 
 
 
289 aa  281  9e-75  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  51.72 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  50.69 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  50.34 
 
 
285 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  49.66 
 
 
285 aa  265  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  49.66 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  49.66 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  49.66 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  49.66 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  49.66 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  49.66 
 
 
285 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  49.31 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  49.31 
 
 
285 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  48.28 
 
 
285 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  47.24 
 
 
286 aa  248  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  46.9 
 
 
286 aa  247  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  46.9 
 
 
286 aa  247  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.94 
 
 
284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.03 
 
 
283 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.03 
 
 
284 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.46 
 
 
313 aa  215  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.12 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  40.55 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.14 
 
 
313 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.15 
 
 
284 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40 
 
 
305 aa  208  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.56 
 
 
287 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.86 
 
 
286 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  44.15 
 
 
283 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.75 
 
 
308 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.44 
 
 
284 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  38.41 
 
 
309 aa  202  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.03 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.31 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.81 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  37.9 
 
 
316 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.29 
 
 
323 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.96 
 
 
311 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1613  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  37.31 
 
 
344 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  36.94 
 
 
307 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  39.93 
 
 
283 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  41.64 
 
 
285 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  39.04 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  38.36 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  41.3 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  40.48 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  38.57 
 
 
330 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  37.38 
 
 
307 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.07 
 
 
312 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.84 
 
 
307 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  38.23 
 
 
284 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  40.41 
 
 
284 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  40.41 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  40.41 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  38.23 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  38.23 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  38.23 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  42.86 
 
 
281 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.31 
 
 
307 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  37.88 
 
 
286 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.34 
 
 
308 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  37.88 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  37.88 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  37.88 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  37.88 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  37.88 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  37.88 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  37.88 
 
 
286 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.31 
 
 
309 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  36.64 
 
 
284 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  36.64 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  36.64 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  36.64 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  36.64 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  36.64 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  36.64 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  37.54 
 
 
292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1039  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.52 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.82 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.42 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  36.43 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.82 
 
 
354 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  37.8 
 
 
292 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.42 
 
 
354 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  36.69 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.76 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000185169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  36.3 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>