28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0390 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  47.35 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  46.81 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  32.22 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  33.04 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  30.93 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  30.96 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  26.79 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  26.94 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  25.1 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2551  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  25.32 
 
 		 192 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  26.09 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  25.79 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  25.21 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  25.1 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  23.69 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  24.44 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  23.58 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2323  aminoglycoside phosphotransferase, C-terminal region  35.21 
 
 		 88 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00456612  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  37.88 
 
 		 595 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2322  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  32.53 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00287241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 		 589 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  23.05 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  23.65 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>