148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0386 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  38.81 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  36.14 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  35.64 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  35.64 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  36.14 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  35.15 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  34.16 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  29.33 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  32.67 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  31.88 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  30.2 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  31.92 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  31.92 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  27.4 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  29.3 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  29.3 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  28.22 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  28.23 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  28.84 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  28.71 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  27.88 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  28.23 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  26.98 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  27.88 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  27.83 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  28.37 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  27.59 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  27.05 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  25.48 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  25.48 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  28.57 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  26.17 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  28.08 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  28.08 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  28.71 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  28.22 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  28.71 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  27.85 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  25.48 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  25.6 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  27.27 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  28.71 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  28.71 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  28.02 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  28.29 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  25.96 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  30.73 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  27.94 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  28.37 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  26.83 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  27.72 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  32.08 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  28.71 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  26.51 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  26.73 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  22.17 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  28.23 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  28.23 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  28.16 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  27.75 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  26.24 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  26.11 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  27.75 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  26.73 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  25.62 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21880  phosphate transport regulator related to PhoU  30.41 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  24.39 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  26.6 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  23.56 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.74 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  25.36 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  25.62 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  25.73 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.68785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>