More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0342 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 331 aa  681    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 		 321 aa  352  7e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.38 
 
 		 319 aa  351  8.999999999999999e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.14 
 
 		 323 aa  315  9e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.69 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 		 315 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 		 325 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 		 319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.57 
 
 		 319 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.06 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.74 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.58 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.95 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  47.17 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.96 
 
 		 322 aa  292  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.11 
 
 		 324 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.95 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.86 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.79 
 
 		 316 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.8 
 
 		 324 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.98 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.47 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.52 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.34 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.12 
 
 		 316 aa  282  5.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.62 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.65 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.47 
 
 		 322 aa  281  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  46.84 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.27 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.28 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.84 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.84 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  45.51 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.5 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.33 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.97 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.56 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.06 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.28 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.19 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44 
 
 		 340 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.08 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.25 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.34 
 
 		 326 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.62 
 
 		 314 aa  275  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.25 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.5 
 
 		 309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.25 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.71 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.62 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.15 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.47 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.03 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47 
 
 		 315 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>