More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0264 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 320 aa  658    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  57.5 
 
 		 297 aa  328  7e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  52.1 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  43.42 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  43.04 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  43.28 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  42.39 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  42.76 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  38.73 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  41.09 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  41.11 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  38.64 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  39.5 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  39.78 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  35.65 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  43.85 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  34.74 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  35.19 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  32.59 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  31.29 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  34.08 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.39 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.45 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  35.12 
 
 		 371 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.34 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.14 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  30.55 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.18 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.44 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.09 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  31.2 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.53 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.77 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  28.34 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  35.62 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  32.06 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.75 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.99 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  27.15 
 
 		 351 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.14 
 
 		 344 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  33.61 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.53 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.62 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.71 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.81 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  27.33 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.51 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  26.47 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  31.06 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  32.18 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.74 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.74 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  27.85 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  27.18 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 		 350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  27.27 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  25.89 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.53 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.09 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.46 
 
 		 355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.15 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  27.88 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  28.39 
 
 		 362 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  30.19 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  24.31 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  28.98 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  25.74 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.18 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.29 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  29.35 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.97 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>