More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0249 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 392 aa  803    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  46.8 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  42.27 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  47.21 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  37.34 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  38.21 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  41.86 
 
 		 380 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  39.13 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  45.03 
 
 		 385 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  42.01 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  38.56 
 
 		 382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  39.44 
 
 		 376 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  40.26 
 
 		 381 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  38.56 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  39.52 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  38.05 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  41.93 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  38.46 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  36.76 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  38.38 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  37.53 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  37.06 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  37.76 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  35.71 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  38.27 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  41.58 
 
 		 383 aa  258  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  40.82 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  36.73 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  35.81 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  32.99 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  32.99 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  36.34 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  37.56 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  32.56 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  37.28 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  35.82 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  34.61 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  32.91 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  33.5 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  36.36 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  36.39 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  35.34 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  35.14 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  32.99 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.5 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.52 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.68 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.27 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.81 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  30.2 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.31 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.89 
 
 		 644 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.02 
 
 		 429 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  29.55 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.49 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  31.65 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  28.82 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.98 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.38 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.95 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  31.74 
 
 		 896 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.5 
 
 		 878 aa  166  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  31.09 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.63 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.37 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.82 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.38 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.79 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.23 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.56 
 
 		 425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.08 
 
 		 880 aa  163  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.4 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  31.61 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.97 
 
 		 415 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.54 
 
 		 414 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.57 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.23 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.65 
 
 		 678 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.88 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  30.43 
 
 		 879 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 430 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.4 
 
 		 630 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  30.64 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  29.97 
 
 		 422 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.82 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  30.25 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  31.33 
 
 		 441 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.15 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  29.57 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.98 
 
 		 657 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  29.57 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.32 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 		 605 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.32 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>