210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0167 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
244 aa  513  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  58.92 
 
 
242 aa  298  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  59.58 
 
 
249 aa  294  8e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  58.62 
 
 
236 aa  290  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  55.42 
 
 
250 aa  277  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.87 
 
 
241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  51.24 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  51.87 
 
 
242 aa  263  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  51.87 
 
 
242 aa  262  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.77 
 
 
253 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 
251 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.86 
 
 
264 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.3 
 
 
262 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.44 
 
 
242 aa  229  3e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.72 
 
 
262 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.72 
 
 
262 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.72 
 
 
262 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.72 
 
 
262 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.72 
 
 
262 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.72 
 
 
262 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.72 
 
 
262 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.84 
 
 
256 aa  228  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.3 
 
 
262 aa  228  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.13 
 
 
262 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.98 
 
 
256 aa  225  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.61 
 
 
268 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  46.47 
 
 
262 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.35 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  45.19 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.5 
 
 
233 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 
247 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.54 
 
 
240 aa  209  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.35 
 
 
260 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.93 
 
 
262 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  45.83 
 
 
234 aa  202  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.5 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.27 
 
 
247 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.44 
 
 
279 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.8 
 
 
268 aa  197  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.11 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.93 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.08 
 
 
233 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.54 
 
 
233 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.8 
 
 
266 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.14 
 
 
235 aa  192  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.36 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.98 
 
 
270 aa  189  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 
240 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
263 aa  188  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.42 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.04 
 
 
252 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.87 
 
 
670 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.28 
 
 
642 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.26 
 
 
268 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.23 
 
 
647 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.33 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.33 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.55 
 
 
243 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.87 
 
 
637 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.16 
 
 
642 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.59 
 
 
260 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  39.51 
 
 
253 aa  178  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 
245 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 
657 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  41.78 
 
 
262 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.27 
 
 
277 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  43.16 
 
 
641 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.49 
 
 
259 aa  175  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.68 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.55 
 
 
303 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  43.23 
 
 
637 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.44 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.4 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.79 
 
 
646 aa  171  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.22 
 
 
271 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  44.25 
 
 
642 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  43.32 
 
 
255 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.59 
 
 
266 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.76 
 
 
266 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.76 
 
 
266 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.76 
 
 
266 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.76 
 
 
266 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.76 
 
 
266 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.76 
 
 
266 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.77 
 
 
655 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.09 
 
 
268 aa  166  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.75 
 
 
261 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  40.48 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0225  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  36.36 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.535375  normal  0.600106 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.42 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  38.87 
 
 
358 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.79 
 
 
639 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>