More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0121 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 333 aa  687    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  53.87 
 
 		 291 aa  291  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  51.68 
 
 		 284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  48.56 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  43.66 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  45.52 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  43.49 
 
 		 285 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  44.1 
 
 		 298 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  43.75 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  42.12 
 
 		 299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  38.56 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  43.01 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  37.87 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  42.41 
 
 		 222 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  38.33 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  36.62 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  37.55 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  38.02 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  37.4 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  40.71 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  40.1 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  39.41 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.16 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  51.11 
 
 		 382 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  50 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  37.24 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.89 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.24 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.18 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  47.02 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.91 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.7 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.91 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  40.85 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.68 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.78 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.91 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.92 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.91 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.91 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  40.22 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.79 
 
 		 368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  43.39 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  47.52 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  52 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  48 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  52.8 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  49.21 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  36.9 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  44.38 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.96 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  44.37 
 
 		 381 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  45.18 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  37.66 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  34.95 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  31.75 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  36.67 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  34.13 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  51.16 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.48 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  34.01 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 		 381 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  37.17 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  37.17 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  37.17 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  50.78 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  47.2 
 
 		 360 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  47.62 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  37.4 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  46.83 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  46.62 
 
 		 581 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  34.36 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  44.96 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  46.27 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  44.08 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  33.67 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  43.36 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  43.36 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  48.8 
 
 		 435 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  39.06 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.1 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  36.44 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  36.75 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  48.46 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  46.83 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.77 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  48.84 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.19 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  36.64 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  35.29 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>