More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0116 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  51.33 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  51.96 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  56.38 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  51.55 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  46.08 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  52.48 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  48.45 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  48.04 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  47.96 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  47.06 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  43.88 
 
 		 99 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  48.94 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  43.75 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  43.75 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  46.94 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  46.23 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  46.46 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  47.32 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  47.06 
 
 		 101 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  46.39 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  45.28 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  51.55 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  48.45 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  46.08 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  49.48 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  43.56 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  45.36 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  41.58 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  43.56 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  44.21 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40.59 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  43.56 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  42.27 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  42.16 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.43 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  41.41 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  42.42 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  49.4 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  41.51 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  42.42 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  47.06 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  39.58 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  42.72 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  39.58 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  39.6 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  39.58 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0509  hypothetical protein  68.42 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0674333  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  40.78 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  45.26 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  44.94 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  45.83 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  39.42 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  43.9 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  41.05 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  39.42 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  43.9 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  39.42 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  43.9 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  38.14 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  38.53 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  40.82 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  41.76 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  43.21 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  43.21 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  38.32 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  35.64 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  39.42 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  42.42 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  41.84 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  38.46 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  36.54 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  39.42 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  39.42 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  39.42 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  37.86 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  37.25 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>