167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0109 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  100 
 
 		 270 aa  565  1e-160  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  32.54 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  30.53 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  31.89 
 
 		 241 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  31.01 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  30.8 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  30.5 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  29.34 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  29.67 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  29.02 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  28.19 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  28.85 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  27.99 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  27.61 
 
 		 239 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  27.34 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  28.57 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  28.52 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  27.84 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  27.03 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  27.03 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  27.8 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  28.12 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  26.64 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  26.64 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  26.25 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  29.46 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  25.57 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  27.45 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  26.64 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  27 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  27.45 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  25.19 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  28.07 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  25.57 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  25.57 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  25.49 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  25.49 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  28.24 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  25 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  24.71 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  28.57 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  25.47 
 
 		 244 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  29.96 
 
 		 238 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  26.87 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  25.19 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  24.81 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  26.67 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  26.42 
 
 		 245 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  24.71 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  24.71 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  24.81 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  24.71 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  24.71 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  25.19 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  25.19 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  25.19 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  25.19 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  25.19 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  25.19 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  25.19 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  25.19 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  22.48 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  24.42 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  27.56 
 
 		 570 aa  69.3  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  29.26 
 
 		 578 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  29.33 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  25.85 
 
 		 574 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  26.67 
 
 		 598 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  28.95 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  25.83 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  27.35 
 
 		 572 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  26.82 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  26.45 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  24.05 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  28.76 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  23.91 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  23.35 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  23.38 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  23.63 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  29.18 
 
 		 580 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  23.63 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  23.63 
 
 		 572 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  23.63 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  23.63 
 
 		 573 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  26.03 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  24.26 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  25.86 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  23.21 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  27.16 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  23.63 
 
 		 572 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  23.63 
 
 		 572 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  25.11 
 
 		 580 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  25.54 
 
 		 592 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  23.21 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  29.23 
 
 		 577 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  25.32 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  25.32 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  26.55 
 
 		 584 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  27.43 
 
 		 560 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>