More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0108 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  100 
 
 
394 aa  804    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  57.11 
 
 
395 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  59.23 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  56.63 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  42.27 
 
 
398 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  41.9 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  42.02 
 
 
395 aa  319  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  39.84 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  40.77 
 
 
398 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  39.42 
 
 
396 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  39.63 
 
 
393 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  40.96 
 
 
395 aa  292  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  38.89 
 
 
397 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  36.57 
 
 
397 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  37.93 
 
 
397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  38.66 
 
 
398 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  38.62 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  37.66 
 
 
396 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  39.23 
 
 
398 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  37.27 
 
 
396 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  38.38 
 
 
393 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 
393 aa  275  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  38.03 
 
 
395 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  37.89 
 
 
397 aa  269  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  38.4 
 
 
461 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  36.41 
 
 
396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  36.27 
 
 
393 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  35.81 
 
 
394 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  37.23 
 
 
400 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  35.28 
 
 
398 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  35.28 
 
 
398 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
404 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  31.88 
 
 
405 aa  186  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 
397 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  28.22 
 
 
403 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  29.58 
 
 
411 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  30.43 
 
 
376 aa  156  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.46 
 
 
377 aa  156  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.46 
 
 
377 aa  156  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  27.08 
 
 
379 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  30.92 
 
 
389 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 
389 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  29.29 
 
 
389 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  29.2 
 
 
375 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  30.71 
 
 
412 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  29.74 
 
 
383 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  31.85 
 
 
413 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.55 
 
 
367 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 
405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  27.35 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 
407 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  29.33 
 
 
385 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  30.1 
 
 
379 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 
375 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  29.26 
 
 
382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  28.06 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  28.42 
 
 
387 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 
381 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  27.5 
 
 
377 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  30.48 
 
 
396 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  27.47 
 
 
392 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  27.08 
 
 
397 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 
390 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  28.26 
 
 
387 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  29.3 
 
 
389 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  28.53 
 
 
387 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.45 
 
 
392 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  30.32 
 
 
392 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  28.26 
 
 
387 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  30.87 
 
 
396 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  28.29 
 
 
391 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  27.7 
 
 
375 aa  144  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 
375 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 
380 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  28.17 
 
 
375 aa  144  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  29.94 
 
 
397 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 
388 aa  143  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  31.36 
 
 
373 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  29.62 
 
 
386 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  28.29 
 
 
387 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.07 
 
 
385 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 
415 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  29.98 
 
 
402 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  30.35 
 
 
410 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  26.92 
 
 
392 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  28.3 
 
 
386 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  29.91 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  27.83 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.79 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  27.88 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  27.99 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  27.99 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  27.41 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  29.4 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  26.46 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 
406 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  29.89 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>