More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0092 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0092  Transaldolase  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001154  transaldolase  47.09 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000861143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2019  fructose-6-phosphate aldolase  41.18 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1908  fructose-6-phosphate aldolase  41.18 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000869598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0975  fructose-6-phosphate aldolase  41.89 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2241  fructose-6-phosphate aldolase  40.72 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.605165  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2523  fructose-6-phosphate aldolase  41.44 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.310878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1319  fructose-6-phosphate aldolase  41.44 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.144476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0896  fructose-6-phosphate aldolase  40.99 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2640  fructose-6-phosphate aldolase  40.27 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305368 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0883  fructose-6-phosphate aldolase  40.99 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00792  fructose-6-phosphate aldolase 1  40.99 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2817  transaldolase  40.54 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00809  hypothetical protein  40.99 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2819  fructose-6-phosphate aldolase  40.99 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4441  fructose-6-phosphate aldolase  41.18 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.933365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4444  fructose-6-phosphate aldolase  41.18 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4515  fructose-6-phosphate aldolase  41.18 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0850  fructose-6-phosphate aldolase  40.09 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4326  fructose-6-phosphate aldolase  40.72 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0332  fructose-6-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4357  fructose-6-phosphate aldolase  40.72 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1068  Transaldolase  38.22 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000767665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1939  Transaldolase  37.78 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  35.94 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4486  fructose-6-phosphate aldolase  42.13 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4069  fructose-6-phosphate aldolase  42.13 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4394  fructose-6-phosphate aldolase  42.13 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03832  fructose-6-phosphate aldolase 2  42.13 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4433  fructose-6-phosphate aldolase  41.67 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03781  hypothetical protein  42.13 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4181  fructose-6-phosphate aldolase  42.13 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4039  transaldolase  42.13 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3551  fructose-6-phosphate aldolase  38.01 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5407  fructose-6-phosphate aldolase  41.63 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  35.91 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  35.91 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  35.19 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  34.11 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  36.06 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  33.78 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  35.98 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  36.11 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  34.91 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  33.02 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  34.43 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  33.03 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  34.72 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  34.88 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  34.43 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  34.43 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  31.02 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  34.11 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  34.11 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  36.45 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  35.51 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  33.64 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  35.35 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  33.8 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  33.64 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  32.71 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  33.18 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  35.05 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  34.11 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0561  putative translaldolase  33.49 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  33.96 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2213  putative translaldolase  33.49 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  34.11 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  34.11 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  35.98 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  34.42 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  33.8 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  33.33 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  32.88 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  32.55 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1679  putative translaldolase  32.7 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  33.96 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1224  putative translaldolase  33.02 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  32.55 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  33.02 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  36.79 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  33.8 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  32.24 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  32.58 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  30.73 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  31.94 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  29.36 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  34.58 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>