More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0091 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  100 
 
 
386 aa  791  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
377 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
406 aa  215  1e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  30.34 
 
 
369 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  33 
 
 
379 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
470 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.09 
 
 
461 aa  162  8e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.78 
 
 
469 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.82 
 
 
469 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.56 
 
 
477 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
459 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.62888e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
469 aa  156  5e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.12 
 
 
486 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
466 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
452 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
469 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.08474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  34.81 
 
 
469 aa  152  9e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  28.9 
 
 
451 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  30.67 
 
 
477 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
451 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.25 
 
 
490 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  2.98579e-06  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.33 
 
 
463 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
469 aa  148  2e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.32 
 
 
457 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
490 aa  147  4e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
487 aa  146  7e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
400 aa  146  7e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
465 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  29.74 
 
 
497 aa  145  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
447 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
445 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  30.94 
 
 
467 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  27.12 
 
 
398 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
455 aa  141  2e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
462 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  28.94 
 
 
389 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  27.91 
 
 
518 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  26.76 
 
 
357 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.77 
 
 
447 aa  140  4e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  31.56 
 
 
456 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
509 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
489 aa  139  9e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  31.23 
 
 
456 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  31.38 
 
 
481 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  29.71 
 
 
490 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
484 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  29.11 
 
 
464 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  30.84 
 
 
452 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
458 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
504 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  33.93 
 
 
450 aa  137  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
469 aa  137  3e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  33.76 
 
 
409 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  30.9 
 
 
456 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3672  ATP-binding region ATPase domain protein  28.93 
 
 
459 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
459 aa  136  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
454 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.6 
 
 
481 aa  136  6e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  4.23782e-09 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  26.45 
 
 
456 aa  136  6e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
373 aa  136  6e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
441 aa  136  7e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
466 aa  136  7e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.1534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.89 
 
 
370 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
444 aa  136  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.97 
 
 
310 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
464 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  25.08 
 
 
397 aa  135  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
496 aa  135  1e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  29.22 
 
 
460 aa  135  1e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
524 aa  135  1e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  28.14 
 
 
476 aa  135  1e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  29.78 
 
 
408 aa  135  1e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
455 aa  134  2e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
472 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.76677e-06 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
469 aa  134  2e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  27.07 
 
 
459 aa  134  2e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  28.75 
 
 
456 aa  134  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
465 aa  134  2e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.9 
 
 
473 aa  134  2e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  30.26 
 
 
467 aa  135  2e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
469 aa  134  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
472 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
352 aa  133  4e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  31.29 
 
 
480 aa  133  4e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  26.76 
 
 
357 aa  133  4e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
437 aa  134  4e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
389 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
500 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
427 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  30.77 
 
 
470 aa  133  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  31.23 
 
 
427 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
490 aa  132  7e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
457 aa  133  7e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2756  ATP-binding region ATPase domain protein  26.83 
 
 
474 aa  132  8e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
472 aa  132  8e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  27.96 
 
 
389 aa  132  8e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
472 aa  132  8e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  30.43 
 
 
471 aa  132  8e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
472 aa  132  8e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  28.2 
 
 
457 aa  132  1e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>