More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0090 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  57.34 
 
 		 226 aa  257  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.5 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  45.63 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  40.99 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.53 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.34 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  41.26 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  44.8 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  39.46 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.22 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  42.92 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.91 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  40.18 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.41 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  40.89 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  40.89 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.14 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  41.89 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.64 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  42.47 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.01 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  40.53 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.53 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  40.27 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0800  response regulator receiver  41.55 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.271408  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  40.45 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  39.19 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.06 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  42.01 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>