More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0089 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0089  Redoxin domain protein  100 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0773  Redoxin domain protein  36.27 
 
 
323 aa  118  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0090  Redoxin domain protein  35.53 
 
 
231 aa  104  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0199  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.49 
 
 
177 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  36.62 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.31 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2372  hypothetical protein  29.9 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000519623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1674  redoxin domain-containing protein  30.65 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  31.34 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  31.9 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  31.94 
 
 
447 aa  65.1  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  32.88 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.33 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.88 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.88 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  32.19 
 
 
173 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  28.57 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2369  hypothetical protein  26.8 
 
 
365 aa  62.4  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000132593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  30.97 
 
 
172 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  30.97 
 
 
165 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30.07 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.68 
 
 
173 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  35.43 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  30.52 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.48 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.52 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  23.67 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  31.5 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  31.9 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  31.3 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1078  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.28 
 
 
383 aa  58.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.899255  hitchhiker  0.00036256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  24.12 
 
 
196 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0722  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.45 
 
 
280 aa  58.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  29.14 
 
 
183 aa  58.2  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  23.94 
 
 
194 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  29.03 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  29.03 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  29.03 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.03 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  28.28 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  28.28 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
375 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.71 
 
 
342 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  28.71 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  29.13 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  32.28 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.87 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  26.98 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  33.6 
 
 
636 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.85 
 
 
378 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0907  Redoxin domain protein  30.16 
 
 
407 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000971835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  29.29 
 
 
195 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.65 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  28.39 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  27.91 
 
 
179 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  26.37 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  26.37 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  26.37 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  30.92 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  32.8 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  26.37 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  26.37 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.13 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  25.58 
 
 
237 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  32.67 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.71 
 
 
280 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  24.67 
 
 
182 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.93 
 
 
168 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  27.87 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  26.61 
 
 
369 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.58 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0399  cytochrome c-type biogenesis protein G  29.29 
 
 
181 aa  55.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1688  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  34.75 
 
 
175 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.526463  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  29.25 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  31.68 
 
 
193 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.9 
 
 
437 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000020628  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  32.32 
 
 
199 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.26 
 
 
446 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.79 
 
 
422 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 
447 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.87 
 
 
455 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.5 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  32.77 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.49 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  31.34 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2106  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
367 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.01 
 
 
380 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  24.88 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>